教育

• 物理學博士，印第安納大學，布盧明頓(2005-2012)
• 謝裏夫理工大學物理學碩士，德黑蘭，伊朗(2005)
• 伊朗設拉子設拉子大學物理學學士(2002年)

配置文件

我是聖猶大兒童研究醫院的一名科學家。我目前的研究目的是利用基於潛在生物過程的計算模型，並利用物理定律對其進行表征，為癌症提供機械的見解。隨著個體化癌症治療的出現，個體腫瘤的特征及其對治療的反應的改變變得至關重要。我采取多尺度的方法來解決這一挑戰，通過整合從細胞和組織到全身的數據，建模個體腫瘤的時空異質性，並探索它們如何改變腫瘤對治療的反應。

研究的興趣

• 組織的多尺度計算模型
• 腫瘤生長和治療反應的個體化模型
• 腫瘤的異質性
• 基於圖像的計算生物學

專業的活動:

榮譽和獎勵

出版物

書的章節

• 斯瓦特M.，托馬斯g.l.，貝爾蒙特J.M.， Shirinifard A.， Hmeljak M.， Glazier J.A.(2012)。“使用CompuCell3D多尺度組織建模。”細胞生物學方法，第110卷。

同行評議的出版物

1. 斯瓦特m.h.，托馬斯g.l.， Shirinifard A.， Clendenon s.g.， Glazier J.A.(2015)。實體腫瘤中的湧現分層選擇降低腫瘤細胞的粘結力:使用CompuCell3D的多細胞、虛擬組織腫瘤演化模型。《公共科學圖書館•綜合》。10 (6):e0127972。
2. Stewart E.， Shelat A.， Bradley C.， Chen X.， Federico S.， Thiagarajan S.， ShirinifardA。， Bahrami A.， Pappo A.， Qu C.， Finkelstein D.， Sablauer A.， Dyer M.A.(2015)。人類原位神經母細胞瘤異種移植的發展和特征Dev雜誌。pii: s0012 - 1606(15) 00060 - 3。
3. Stewart E, Goshorn R, Bradley C, Griffiths l.m.， Benavente C.， Twarog N.R.， Miller g.m.， Caufield W, Freeman b.b.3, Bahrami A.， Pappo A.， Wu J.， Loh A.， Karlström Å。， Calabrese C.， Gordon B.， Tsurkan L.， Hatfield M.J.， Potter p.m.， Snyder S.E.， Thiagarajan S.， Shirinifard A.， Sablauer A.， Shelat a.a.， Dyer M.A.(2014)。“針對尤文氏肉瘤中的DNA修複通路。”細胞眾議員9(3):829 - 41。
4. 斯魯卡·j.p.， Shirinifard A.，斯瓦特·M.， Cosmanescu A.， Heiland R.和Glazier J.A(2014)。細胞行為本體論:描述真實細胞和模型細胞的內在生物學行為。生物信息學,doi: 10.1093。
5. Shirinifard A.， McCollum C.W.， Bolin m.b.， Gustafsson J.Å。(2013)，“血管新生芽生長動態的三維定量分析”。發展Dynamics.242(5): 518 - 26所示。
6. Steinkamp M.， Kanigel-Winner K.， Davies S.， Muller C.， Zhang yi .， Hoffman R. M.， Shirinifard A.， Moses M.， Jiang Y.， Wilson B. S.(2013)，“卵巢腫瘤附著、侵襲和血管化反映腹膜中獨特的微環境:異種移植和數學模型的研究”。分子與細胞腫瘤學前沿3:97。doi: 10.3389。
7. 王誌強，王誌勇，王誌勇，王誌勇，王誌勇(2012)“Bruch膜-視網膜色素上皮-光感受器外段複合體黏附失敗對脈絡膜新生血管形成的影響:計算機模擬研究”。PLoSComputBiol 8 (5): e1002440。doi: 10.1371 / journal.pcbi.1002440。
8. Heiland R.， Swat M.， Sluka J.， Zaitlen B.， Shirinifard A.， Thomas g.l.， Lumsdaine A.和Glazier J.A.“為CompuCell3D可視化細胞及其連接性圖。第二屆IEEE生物數據可視化研討會。
9. 張勇，湯國棟，斯瓦特M.，謝裏尼法德(2011)。計算機模擬由於差異粘附而產生的細胞分選PLoS ONE 6(10): e24999。
10. Popławski N.J.， Shirinifard A.， Ubirajara A.， Gens J.S.， Swat M.， Glazier J.A.(2010)。模擬三維血管腫瘤的前部不穩定性和侵襲性PLoS ONE 5(5): e10641。
11. Shirinifard A.， Gens j.s.， Zaitlen b.l.， Popławski N.J.， Swat M.， Glazier J.A(2009)。"三維多細胞模擬腫瘤生長和血管生成"《公共科學圖書館•綜合》。4 (10):e7190。
12. Merks r.m.， Perryn e.d.， Shirinifard A.， Glazier J.A.(2008)。"新生中接觸抑製的趨化性和新生血管生長"PLoSComput雜誌4 (9):e1000163。
13. Popławski N.J.， Shirinifard A.， Swat M.， Glazier J.A.(2008)。“使用glazer - graner - hogeweg模型和CompuCell3D建模環境模擬單一物種細菌-生物膜的生長。”數學Biosci Eng。4月;5(2): 355 - 88。
14. Shojai F.， Shirinifard A.(2005)。波西米亞量子宇宙學的經典和量子極限國際現代物理學報D，第14卷，1333-1345頁(2005)。