全文
利奧諾拉Casas-Avila1 #瑪格麗塔Valdes-Flores1 #加芙Cordero-Olmos2塞西莉亞E Urquijo-Torres1勞拉Hernandez-Gomez3.何塞·R Garcia-Sanchez4雷蒙M Coral-Vazquez4拉斐爾Franco-Cendejas5克勞迪婭一Colin-Castro5Maria de la Luz Arenas-Sordo1 *
1墨西哥國家康複研究所遺傳係211月20日,墨西哥,國家醫療中心耳鼻咽喉科
3.墨西哥國家康複研究所聽力學部
4墨西哥國立理工學院
5墨西哥國家康複研究所感染科
#兩位作者貢獻相同
*通訊作者:María de la Luz Arenas-Sordo,墨西哥國家康複研究所遺傳係,電話:52 (55) 59991000;電子郵件:mlarenassordo@hotmail.com
目的:探討耳硬化症與耳基因多態性之間的關係COL1A1在墨西哥的病人。
方法:采用病例對照研究,90例手術治療中確診耳硬化症,135例對照組。
用樣本容量OCCE和Quanto程序計算樣本量。收集所有患者的病史,並進行完整的聽力學檢查:耳鏡檢查、測聽、鼓室測量和鐙骨反射。rs2586498 (A/G), rs1107946 (G/T), rs2141279 (C/T), rs1800012 (G/T)COL1A1基因進行了分析。獲得優勢比並進行logistic回歸分析。
結果:約半數患者有耳硬化症家族史(56%),幾乎所有病例(91%)均為雙側影響。在墨西哥患者中,所有的多態性都處於Hardy-Weinberg平衡,沒有顯示與耳硬化症相關。
結論:我們的研究結果表明COL1A1在我們的人群中,基因對耳硬化症的遺傳風險沒有顯著貢獻。所分析的多態性都沒有顯示出與該疾病有統計學上的顯著相關性。然而,有必要研究同一基因和其他基因的其他多態性。
耳硬化症;COL1A1;多態性;墨西哥病人
耳硬化症是一種影響耳膜的疾病,由骨代謝的變化引起。它是成年人傳導性聽力損失最常見的原因之一,是進行性[1]。它是5-9%聽力喪失病例和18-22%傳導性[2]病例的病因。耳硬化症多發於女性(男女比例為2:1)[3]。
耳硬化症的發展方式尚不清楚,考慮到遺傳方麵,耳硬化症可以被認為是多因素和遺傳異質性的,但也可能是,在少數情況下,繼發於常染色體顯性遺傳,外顯[4]降低。到目前為止,已有8個基因座與常染色體顯性耳硬化症相關,分別是15q25-q26染色體上的OTSC1, 7q34-q36染色體上的OTSC2, 6p21.3-p22.3染色體上的OTSC3, 16q22.1-q23.1染色體上的OTSC4, 3q22-q24染色體上的OTSC5, 6q13-q16.1染色體上的OTSC7, 9p131 -q21.11染色體上的OTSC8,最後是OTSC10 (1q411-44)[2,5-12]。其臨床表現以聽力喪失、耳鳴為主要特征,患者也可出現眩暈[12-14]。聽力損失通常是傳導性的,但約10%的患者發展為感音神經性聽覺減退,通常在該病的晚期耳蝸形式,但也有部分患者可首發[5,13,14]。
COL1A1是第一個與耳硬化症有關的基因。重要的是,該基因還與骨質疏鬆症相關,骨質疏鬆症通常會導致傳導性聽力損失,如成骨不全症[15-17]。成骨不全和骨質疏鬆兩種疾病都與此有關COL1A1基因和兩者都有聽力損失,在某些成骨不全病例中更重要,因為這種疾病是孟德爾病,而骨質疏鬆症是多因素的[18,19]。一些研究表明,某些基因多態性與耳硬化有關,尤其是在白人患者中[20]。其他基因也參與其中,如TGFB1[21]和RELN[22]。本研究的目的是確定耳硬化與rs1107946、rs2586498、rs2141279和rs1800012的多態性之間是否存在關聯COL1A1.目前關於這方麵的研究很少,而且存在爭議。
病人
一項病例對照研究對手術治療中確診的90例耳硬化症患者和135例對照組患者進行了研究。用以下程序估計樣本量:樣本量OCCE和Quanto。我們使用每個多態性的小等位基因頻率。統計冪值為80%,顯著性為5%。每個多態性的結果都是不同的,所以我們使用了最大的樣本量,這樣所有的多態性都被包括在內。
收集所有患者的病史數據,並進行完整的聽力學檢查:耳鏡檢查、測聽、鼓室測量和鐙骨反射。所有研究都是根據《赫爾辛基宣言》和《墨西哥一般衛生法》所表達的原則進行的,該項目得到INRLGII倫理委員會的批準,患者簽署了知情同意(編號:83/15)。
對照組進行了聽力測量研究,以確保他們沒有任何臨床發現的耳硬化。
通過問卷收集年齡、性別、近親繁殖、血緣關係、耳硬化症開始年齡、一側或雙側受累、有受累家庭成員數、麻疹病史和激素攝入(女性)等變量。我們根據他們的產地和西班牙語姓氏選擇同質群體。所有的個體都沒有血緣關係,至少有三代出生在墨西哥中部各州的墨西哥混血兒血統。
基因分型
從每個參與者提取外周血樣本,使用Puregene DNA提取試劑盒(Qiagen, Minneapolis, MN, USA)提取DNA。對COL1A1基因中的rs2586498 (A/G)、rs1107946 (G/T)、rs2141279 (C/T)、rs1800012 (G/T) snp進行分析。按照製造商(美國加利福尼亞州福斯特市應用生物係統公司)推薦的條件,使用特定的TaqMan探針進行實時PCR基因分型。簡單地說,每個25µl PCR反應包含1X TaqMan PCR主混合物、100nm特異探針、每個引物900nm特異探針和25ng基因組DNA。樣品在48孔板中使用StepOne™實時PCR係統(應用生物係統)進行檢測。循環條件包括一個初始變性步驟,在95°C,持續10分鍾,然後在92°C,持續15秒,然後60°C,持續1分鍾,循環40次。
統計分析
描述性分析以集中趨勢、均值、眾數和中位數為定量變量,以頻率為定性變量。定量變量比較分析采用aTstudent檢驗,定性變量比較分析采用X2測試。
取比值比,對雙變量分析p值<0.1的變量進行logistic回歸模型。A p <0.05被認為是顯著的。對所有分析的多態性(POPGEN32 ver。1.31,阿爾伯塔大學和國際林業研究中心,加拿大埃德蒙頓)。
56%的患者有耳硬化症家族史,其餘為孤立病例。90名患者中,70%為女性,30%為男性,對照組分別為76%和24%。病例平均年齡為47.63±9.8歲(23 ~ 65歲),對照組平均年齡為41.27±12.05歲(24 ~ 75歲)。82例(91%)為雙側病變,8例(9%)為單側病變,左側病變較多。發病年齡在40歲前占85%,平均演化時間為14.12±9.7年。氣骨間隙為27.58±9.1 dB(11.25 ~ 53.33)。
所有多態性均處於Hardy-Weinberg平衡狀態。病例和對照組的等位基因和基因型頻率非常相似[表1]。在墨西哥患者中,沒有多態性顯示與耳硬化症相關[表2]。
單核苷酸多態性 | 基因型/ Alele | 例(%)N = 90 | 控製(%)N = 135 | p HW |
rs 1107946 | GG | 19日(21.11) | 28日(20.74) | 0.061 |
GT | 59 (65.55) | 98 (72.59) | ||
TT | 12 (13.33) | 9 (6.66) | ||
G * | 97 (53.88) | 154 (57.03) | ||
T | 83 (46.11) | 116 (42.96) | ||
rs 2141279 | CC | 59 (65.55) | 87 (64.44) | 0.11 |
CT | 31 (34.44) | 48 (35.55) | ||
TT | 0 | 0 | ||
C * | 149 (82.77) | 222 (82.22) | ||
T | 31 (17.22) | 48 (17.77) | ||
rs 2586498 | GG | 63 (70) | 100 (74.07) | 0.088 |
AG) | 27日(30) | 35 (25.92) | ||
AA | 0 | 0 | ||
G | 153 (85) | 235 (87.03) | ||
一個* | 27日(15) | 35 (12.96) | ||
rs 1800012 | GG | 71 (78.89) | 105 (77.78) | 0.881 |
GT | 19日(21.11) | 28日(20.74) | ||
TT | 0 | 2 (1.48) | ||
G | 161 (89.44) | 238 (88.15) | ||
T * | 19日(10.56) | 32 (11.85) |
表1:等位基因和基因型分布COL1A1耳硬化症和對照組的SNP多態性。
SNP:單核苷酸多態性。哈代溫伯格平衡。*祖先的等位基因。
單核苷酸多態性 | 選擇的名字 | 基因的位置 | p (X)2 | 或(CI 95%) |
rs1107946 | Pcol2 | 5 '逆流 | 0.51 | 0.88 (0.59 - -1.31) |
rs2141279 | 基因內區15 | 0.87 | 1.04 (0.61 - -1.76) | |
rs2586498 | Int5 / rs7406586 | 基因內區5 | 0.53 | 0.84 (0.47 - -1.50) |
rs1800012 | Sp1 | 基因內區1 (+ 11126) | 0.84 | 0.94 (0.49 - -1.79) |
表2:協會COL1A1墨西哥患者的基因多態性和耳硬化症。
SNP:單核苷酸多態性;p (X)2:來自X的p值2;或:優勢比;置信區間:置信區間
我們發現麻疹背景信息和激素攝入(女性)與耳硬化症之間沒有關聯。所有患者均無血緣或近親繁殖報告。
耳硬化症是一種致殘疾病,因為它會導致聽力喪失。某些起源的參與是毫無疑問的,正如在每個家庭有一個以上成員受影響的家族研究和單卵雙胞胎研究中所證實的[13,15,23]。耳硬化症被認為是一種骨骼疾病;正因為如此,一些參與骨代謝的基因被認為是研究它們與耳硬化症可能關聯的極好的候選基因。那是……的情況COL1A1其中許多多態性已經被研究過。我們研究的三個多態性與其他人群的耳硬化症有關,例如美國人的rs2586498[15],比利時-荷蘭人的rs2141279[16],美國白種人的rs1800012[20][表3]。
美國人麥肯納等人(1998)15 | 比利時-荷蘭 Schrauwen et al. (2012 |
美國白人Chen et al. (2007 | 這項研究(2019年) | |
rs2586498 | 是的 | 沒有 | ||
rs2141279 | 是的 | 沒有 | ||
rs1800012 | 是的 | 沒有 | ||
rs1107946 | 沒有 |
表3:協會COL1A1不同人群的基因多態性與耳硬化症。
一般來說,不同的研究表明,這種關聯在出現時是輕微的;這支持了耳硬化症是一種涉及許多基因的複雜疾病的觀點;反映遺傳異質性和/或其他因素的存在。rs1107946多態性與墨西哥婦女的骨質疏鬆症[24]有關。然而,在來自美國和德國的高加索患者[20]中,或在我們的墨西哥患者中,都沒有發現與耳硬化症的關聯。對西班牙人口進行的研究沒有顯示出與COL1A1而且COL1A2但研究的是另一種類型的多態性,而不是SNPs[25]。
表觀遺傳和許多環境因素都參與其中。同樣重要的是要注意,並不是所有的人口都是相同的,因為他們有不同的基因變異;這一起源,估計不同人群之間的流行程度不同。熟悉的病例顯示本病具有很大的遺傳性[26-28]。顯然,我們的患者不像Komune等人研究的日本患者那樣,呈現出麻疹與發展為耳硬化症風險之間的關聯。有研究表明,持續性麻疹病毒感染引起的免疫反應是耳硬化症[30]的原因之一。自1930年以來,許多作者認為耳硬化症的發生或加重與激素攝入或妊娠有關,但對此存在爭議[14,26,30,31]。我們樣本中的患者沒有表現出與麻疹的相關性,但是我們不能排除這種可能性,因為我們沒有研究手術中獲得的組織,沒有做其他研究,麻疹和激素攝入的數據隻是通過詢問患者來收集的。我們沒有關於患者或對照組接種疫苗的信息,但由於他們的年齡,可能有更多的對照組比病例接種了麻疹疫苗,因為墨西哥於1970年開始使用麻疹疫苗[32]。
由於其重要的結構作用COL1A1在骨頭和以前的聯係COL1A1在墨西哥婦女[24]中發現rs1800012和rs1107946多態性與骨質疏鬆症有關,我們認為這些多態性可能與耳硬化症有關。然而,在我們的墨西哥患者樣本中,並沒有發現與耳硬化症有關的情況。來自美國和德國的白種人患者[20]也同樣缺乏關聯,而在一項針對西班牙人群的研究中沒有顯示出任何關聯COL1A1而且COL1A2多態性[25]。
這種缺乏關聯的COL1A1Rs1800012和rs1107946基因多態性與耳硬化的關係是意料之外的,因為我們提到了骨質疏鬆和聽力損失之間的密切聯係,但我們必須考慮到,即使在同一樣本中,這些和其他基因多態性在一個解剖區域顯示了與骨質疏鬆危險條件的關聯,但在另一個解剖區域卻沒有關聯,如髖關節和脊柱[33,34]。此外,本研究的不足之處在於沒有考慮墨西哥人群的遺傳分層,這可能掩蓋了多態與耳硬化症的關聯,或者另一方麵,這可能導致虛假的關聯。
總之,我們的研究表明COL1A1在這個墨西哥耳硬化症患者樣本中分析的多態性似乎與疾病無關。然而,有必要證實這些發現,並研究同一基因和其他基因中的其他多態性。
作者聲明沒有任何利益衝突。
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文章類型:研究文章
引用:Casas-Avila L, Valdés-Flores M, Cordero-Olmos G, Urquijo-Torres CE, Hernandez-Gomez L,等(2020)COL1A1墨西哥耳硬化症患者的多態性。病例對照研究。耳鼻喉不和症治療1(2):dx.doi.org/10.16966/jodt.110
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