腎髒病學與腎衰竭- Forschen科學

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當你購買了一個有缺陷的套件:你應該更換它還是使用製造商描述的正確方法?

Maryam造成損失Farkhondeh Pouresmaeili

伊朗德黑蘭Shahid Beheshti醫科大學醫學院醫學遺傳學係

*通訊作者:伊朗德黑蘭Shahid Beheshti醫科大學醫學院醫學遺傳學係Farkhondeh Pouresmaeili電話:+ 98 23872572;電子郵件:pouresfar@gmail.com


像我這樣的科研人員,從國外買了一個生物試劑盒,等了好幾個月才收到,想要得到好處,卻沒有任何積極的結果,肯定會寫信給相關公司的技術服務,希望得到一個好的結果。這是我去年購買NucleoSpin Plasma XS從血漿[1]中提取循環DNA時的故事。

我們遇到了一個問題,當我們完成整個步驟,測量光密度(OD)並安排實時PCR時,我們沒有得到信號和峰值,這意味著我們在提取液中沒有DNA。因此,我要求公司指導我如何使用試劑盒,以獲得一個實際良好的DNA恢複結果。技術服務部門建議我們;由於患者血漿中DNA含量的差異很大,我們將用穗狀DNA檢測樣品的製備效率。他們補充說,DNA含量的高度變化使得不可能說製備是否有效。此外,他們說,已知數量的加標DNA,我們可以清楚地將輸入與DNA提取的產量聯係起來。但是,我們在觀察過量物質,但用引物實時沒有信號。我們沒有這樣的峰值來做比較,所以我們想,如果我們可以減少加入裂解緩衝液後的第一次離心,以保留更多的核酸在柱中,並在洗脫樣品時增加離心力,以清空柱中的DNA物質,這可能是可行的。此外,另一個建議是在使用洗脫緩衝液之前對其進行加熱,以獲得更多的DNA回收。

在此基礎上,對提取工藝步驟進行了多次修改,得到了較好的提取效果和較高的循環細胞遊離DNA (ccfDNA)提取率。當然,為了這一成就,我們犧牲了一個套件。

我們決定公布我們的成功,以造福世界各地的同事,他們計劃使用相同的試劑盒,更便宜和高純度,但通過我們在發表的文章[2]中建議的協議。


參考文獻

  1. www.mn-net.com [Ref。
  2. Khani M, Pouresmaeili F, mirfakhrae R(2017)采用標準核旋蛋白血漿XS(NS)試劑盒方案與改進方案比較提取循環細胞遊離DNA濃度。泌尿科開放存取雜誌4:00137。[Ref。

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文章類型:信編輯器

引用:Khani M, Pouresmaeili F(2017)當你購買一個有缺陷的試劑盒:你是應該更換它還是按照製造商描述的正確方法?腎衰竭3(2):doi http://dx.doi.org/10.16966/2380-5498.148

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出版的曆史:

  • 收到日期:2017年10月21日

  • 接受日期:2017年10月25日

  • 發表日期:2017年10月31日