王雪霞(海倫)
王雪霞(Helen)博士
生物統計學助理教授
  • 北德克薩斯大學
    辦公室:聯合圈1155號311430號GAB 459
    丹頓,德克薩斯州76203-5017,美國
    電話:(940) 369 - 8307
    電子郵件:xuexia.wang@unt.edu

教育

  • 統計學/數學科學博士(統計遺傳學)2008年12月密歇根理工大學論文:“考慮LD信息和全基因組應用的遺傳關聯研究”指導老師:張雙林教授
  • MS統計學/數學科學(統計遺傳學)2007年5月,密歇根理工大學,Houghton, MI論文:“全基因組關聯測試的兩階段方法與家族和不相關個體的統一分析”指導老師:張雙林教授
  • 2004年7月首都經濟貿易大學,中國北京論文:《風險投資中雙層委托代理機製研究》指導老師:金向蘭教授
  • 數量經濟學碩士1996年4月東北財經大學中國大連
  • 1993年7月山東師範大學,中國濟南

傳記

王雪霞博士在希望之城工作了一年之後,於2011年8月加入生物統計係。她的主要研究領域是統計遺傳學。她對開發統計方法和計算工具感興趣,以確定影響乳腺癌、結腸癌/直腸癌、肺癌和前列腺癌等複雜疾病易感性的遺傳變異。
她提出了三種兩階段的方法來處理基於核心家庭數據的多重檢測問題;一種新的基於病例對照數據的多標記關聯測試方法。本地血統在測試SNP可能與關聯信號混淆,忽略它可以導致虛假的關聯。她首先從理論上證明,無論人群分層機製如何,在測試SNP時對當地血統的調整足以消除虛假關聯。此外,她還開發了兩種針對當地血統的新穎而強大的關聯測試。
她目前的研究工作包括分析全基因組關聯和下一代測序研究產生的高通量遺傳學數據。她尤其對罕見和常見變異的基於群體和基於家庭的遺傳關聯研究、基因集和途徑分析、基因-基因和基因-環境相互作用、混合群體和基因表達遺傳學感興趣。

除了方法開發,王博士還對與尋求識別複雜疾病易感基因的研究人員合作感興趣。她的合作研究包括尋找乳腺癌、結腸癌/直腸癌、肺癌、前列腺癌、淋巴瘤、心血管疾病、兒童肥胖、1型糖尿病、2型糖尿病、自閉症、治療相關的心功能障礙和兒童癌症存活後的缺血性壞死、造血細胞移植後的繼發性惡性腫瘤發展的遺傳易感性研究。

研究的興趣

我廣泛的研究議程是了解遺傳變異如何有助於複雜疾病的病因學。我的主要目標之一是開發統計方法和計算工具,以識別和表征影響複雜疾病易感性的遺傳變異。除了方法學開發工作,我還與我的合作者密切合作,作為生物統計學家,尋找與治療相關的心功能障礙、繼發性癌症、自閉症和其他疾病的疾病易感因素。

1.遺傳關聯研究的新統計方法

確定遺傳變異與疾病表型之間的關係不僅可以促進對疾病病因的更好理解,而且可以影響疾病風險預測,從而指導一級和二級預防策略。關聯檢驗已用於檢測關聯。我開發了一係列重要的統計測試,以檢測人群中對複雜疾病易感性的遺傳變異,特別是混合人群,如非洲裔美國人和西班牙裔美國人。
1一個。處理人口分層問題的新統計方法
在混合種群中,不同個體間的混合比例可能不同。這種變異可導致疾病與與疾病位點無關的基因位點(即基因定位)的關聯,這種現象被稱為“人群分層”。“如果控製不當,這會產生假陽性和假陰性的關聯信號。”
我是第一個提出並從理論上證明在混合人群中檢測遺傳變異時考慮當地血統差異很重要的人。此外,我還開發了兩種新的關聯方法來調整基因測試區域的當地血統,以消除由於當地血統的混淆效應而產生的虛假關聯。事實上,這一特殊貢獻的重要性(Wang et al。生物信息學2011)對統計遺傳學領域的廣泛引用(被32引用)證明。
在罕見變異關聯分析中,群體分層可能更糟糕,因為罕見變異往往比常見變異表現出更強的和潛在的不同的分層模式。為了糾正遺傳關聯研究中的群體分層,我提出了一種新的方法來測試混合群體(TOWA)中最優加權變異組合的影響,其中分析得出的最優權重可以從現有的表型和基因型數據中計算出來。TOWA增加了罕見變異和那些與表型有強烈關聯的變異的權重。此外,它可以調整關聯的方向,並允許研究對象之間的本地血統差異。這一貢獻發表在著名雜誌遺傳流行病學(Wang at al. Genetic Epidemiology, 2015;影響因子:2.951)。
1 b。檢測多種基因變異的新統計方法
有強有力的證據表明,單個基因中的幾個突變可以相互作用,對觀察到的表型產生很大的影響,這強調了分析多個單核苷酸多態性(SNPs)的重要性,它們共同代表了共同轉錄本和其他功能區域(如啟動子)內的變異。由於大量snp的可用性,涉及幾個緊密相連的位點的基因關聯測試已引起越來越多的興趣。檢測疾病與多基因變異之間關聯的方法正在迅速發展,其中包括Hotelling’s T2檢驗和連鎖不平衡對比試驗。我開發了一種新的基於病例對照數據的多標記關聯測試方法。病例對照研究是遺傳和流行病學研究的典型設計。科學家通過比較病例和對照的遺傳變異的均值和方差-協方差等特征來確定易感疾病的遺傳變異。為了檢測性狀與多重遺傳多態性之間的關聯,我提出了似然比檢驗(Wang et al.;遺傳流行病學,2009)。我的新檢驗是對現有方法的改進,因為它可以同時檢測案例和對照中的均值和方差-協方差矩陣的差異。現有方法隻能在情況和對照中檢測到均值(Hotelling’s T2檢驗)或方差-協方差矩陣(LD對比檢驗)的差異,而不能同時檢測兩者。 Researchers can gain more power using this approach in searching disease genes.
1 c。在下一代測序數據中測試罕見變異關聯的新統計方法
新一代測序技術允許對大量個體的全基因組進行測序,從而使直接檢測罕見變異成為可能。大多數現有的罕見變異關聯研究方法本質上是測試不同加權方案的變異加權組合的效果。這些方法的性能取決於所使用的權重,並且沒有最佳權重可用。盡管越來越多的證據表明複雜疾病是由常見變異和罕見變異共同引起的,但通過對罕見變異給予較大的權重,而對常見變異給予較小的權重,這些方法隻針對罕見變異。我和我的合作者分析得出了最佳權重。基於最優權重,我們提出了一種新的檢驗變量最優加權組合(TOW)效果的檢驗方法和可變權重檢驗變量最優加權組合(VW-TOW)效果的檢驗方法。TOW旨在測試罕見變異的影響。VW-TOW旨在測試罕見和常見變異的影響。TOW和VW-TOW同時適用於定量和定性性狀,允許協變量,可以控製群體分層,並且對因果變量的影響方向具有魯棒性。這些發現發表在《遺傳流行病學》雜誌上(Sha and Wang et al。 Genetic Epidemiology, 2012).
2.癌症治療相關不良結果的遺傳關聯研究
據估計,美國目前有1370萬癌症幸存者,占美國總人口的4%。預計到2022年,這一數字將上升到1800萬。蒽環類藥物是目前用於癌症患者的最有效的化療藥物之一。然而,蒽環類藥物相關的心肌病和放療/化療相關的組織學上明顯的新癌症或隨後的惡性腫瘤(SMNs)是癌症幸存者經曆的最嚴重的治療相關不良事件。在原發癌診斷後20年,第二癌症的累積發病率接近15%,與普通人群相比,癌症幸存者的風險增加了10倍。除了遺傳關聯研究中統計方法的發展,我的研究重點是調查癌症治療相關不良結果的遺傳易感性。
2 a。檢測蒽環類相關心肌病的遺傳易感性
蒽環類藥物是目前癌症患者最有效的化療藥物之一。然而,蒽環類藥物的治療潛力是有限的,因為它們與進行性和不可逆的心肌病有很強的劑量依賴關係,導致充血性心力衰竭。觀察到心肌病風險的個體間差異,例如,在一些患者中,累積暴露低至150mg/m2的蒽環類藥物會導致心肌病,而另一些患者則可以耐受暴露高至1000mg/m2的蒽環素,但沒有心肌病。為了通過識別可能改變蒽環類暴露與心髒毒性風險之間關係的snp來研究觀察到的個體間變異的原因,我進行了一項大規模的候選基因(~2000個基因)研究,並在已知增加心血管疾病風險的基因HAS3上確定了顯著的基因-環境(蒽環類)相互作用。該貢獻已發表在高影響力的臨床腫瘤學雜誌(Wang et al., 2014;影響因子:18;至今被引用25次)。除了在一項大規模候選基因研究中發現的基因HAS3外,我還從一項全基因組關聯研究中發現了與蒽環類藥物相關心肌病相關的基因CELF4的重要基因-環境(蒽環素)相互作用。這篇文章目前發表在著名的臨床腫瘤學雜誌上(Wang et al., 2015)。
2 b。測試第二腦癌的遺傳易感性
化療和放療是大多數兒科癌症的基礎。然而,對於組織學上不同的腦腫瘤或中樞神經係統疾病的治療,在顱骨放射治療後會發生第二腦腫瘤。繼發腦瘤的風險隨著化療和放療的累積暴露而增加。然而,對於任何給定劑量的輻射照射,在發生第二次腦瘤的風險方麵存在顯著的個體間差異,這表明遺傳易感性和治療照射之間的相互作用在發生第二次腦瘤中起著作用。導致第二腦瘤發展的途徑很複雜,可能涉及大量基因的作用和相互作用。然而,很少有研究調查幾個基因的多種變異,部分原因是缺乏適當的統計方法和治療暴露的詳細信息。在我Matthew Larson基金會資助項目(PI: Wang),我提出了新的基於基因和/或途徑的統計方法。使用匹配的病例對照研究設計,我和我的合作者使用兒童腫瘤小組(COG)提供的基礎設施,招募了患有第二次腦瘤的兒童癌症幸存者(84例)和沒有第二次腦瘤的兒童癌症幸存者(231例對照組)。我正在利用新的統計方法和高質量的深度基因分型數據,以及對化療和放療暴露量的仔細測量,全麵研究基因治療的相互作用。這項研究的結果可能會導致臨床理由,為那些被確定為第二腦瘤高風險的人改變治療方法,或者為那些已經接受了必要的治療暴露並被確定為高風險的人進行積極的篩查。
2 c。檢測癌症治療相關後續惡性腫瘤的遺傳易感性
癌症幸存者發生治療相關不良事件的風險很高,累計發生率超過40%。最嚴重的治療相關不良事件之一是組織學上不同的新癌症或隨後的惡性腫瘤(SMNs),也稱為繼發性癌症。這些癌症幸存者所承擔的發病率和死亡率的高負擔使人們有義務了解smn的病因,以便在那些被確定為高風險的患者中製定有針對性的預防和/或幹預策略。我新獲得的UWM研究增長計劃資助(PI: Wang)旨在使用新提出的新統計方法,通過深度識別的外顯子組數據,檢測癌症幸存者中smn的基因-環境(GxE)相互作用。這項研究結果的重要性不僅在於更好地理解與smn相關的複雜生物學途徑中遺傳和環境風險因素的複雜相互作用,而且在於其影響可以指導一級和二級預防策略的風險預測的能力。前瞻性地識別新診斷的患smn高風險的癌症患者可能會帶來個體化治療的機會,通過使用替代療法使治療收益最大化,並使smn風險最小化。
未來研究工作
多效性是一種變異對多種性狀的影響,是複雜疾病中普遍存在的現象。聯合分析高血壓患者的收縮壓和舒張壓等多種特征,可以提高檢測疾病易感基因變異的統計能力。然而,在混合人群(如非洲裔美國人和西班牙裔美國人)中測試多種特征的罕見變異是具有挑戰性的,因為個體變異的極端罕見性,等位基因異質性,以及人群分層的混淆問題。在多性狀的罕見變異關聯分析中,群體分層問題可能更成問題,因為罕見變異往往比常見變異表現出更強的、潛在的不同的分層模式。為了糾正遺傳關聯研究中多性狀的群體分層,我計劃提出兩種新方法來測試混合群體遺傳變異的基於基因或途徑的影響。對於第一種方法,使用廣義線性模型,我將把局部祖先加權變量的組合作為響應變量,將性狀作為預測因子。對於第二種方法,我將使用廣義線性模型將基於祖先的加權劑量評分作為響應變量,將性狀作為預測因子。為了測試多個性狀和基因組區域之間的關聯,我將在第一種方法中開發一個得分測試,在第二種方法中開發一個自舉置信區間測試。我將使用模擬的下一代測序數據來表明所提出的測試具有可控的I型錯誤率,而naïve對多個性狀的現有稀有變異測試的應用導致I型錯誤率膨脹。我將評估新方法在模擬研究和真實數據分析中的力量。
使用提出的新方法,我將測試蒽環類相關心肌病的多個性狀的遺傳易感性。這項研究的發現將為那些被確定為高風險的人改變治療方法,或為那些已經接受了必要的治療暴露並被確定為高風險的人進行積極的篩查提供臨床理由。
我的長期研究目標是組建和領導一個由研究生和博士後組成的資金充足的團隊,這將大大有助於我們理解導致複雜疾病的遺傳變異。在我目前的職位上,我很幸運能夠通過幾個資助項目支持我在全基因組、全外顯子組和外顯子組芯片數據分析的新統計方法的發展。隨著我的職業生涯從目前的水平過渡到下一個階段,這些項目在不久的將來建立了我的研究計劃的核心。我將繼續與我的合作者合作,尋求更多的資助機會,作為主要研究者和共同研究者,以支持我在統計遺傳學和應用流行病學的方法學發展方麵的研究。特別是,在我未來的研究計劃中,我將專注於開發和應用新的統計方法,以滿足遺傳學家和流行病學家的分析需求,並調查對原發性癌症及其治療相關不良結果易感性的遺傳變異。

專業的活動:

工作經驗

  • 助理教授2011年8月至今,威斯康辛大學密爾沃基分校公共衛生學院生物統計學係,威斯康辛州密爾沃基市
  • 助理教授(兼職)2015年4月至今,阿拉巴馬大學伯明翰分校醫學院,伯明翰,AL 35233
  • 2013年9月-至今UWM生物醫學和健康信息學博士課程
  • 2010年9月- 2011年8月加州杜阿爾特希望之城人口科學係
  • 2009年1月- 2010年9月博士後研究員(導師:李明耀博士)賓夕法尼亞大學(UPenn)醫學院生物統計與流行病學學係,費城,賓夕法尼亞州
  • 2005年9月- 2008年12月密歇根州霍頓市密歇根理工大學數學科學係研究生導師和研究助理
  • 2005年3月至8月密蘇裏州斯普林菲爾德密蘇裏州立大學工商管理學院訪問學者
  • 2004年9月至2005年3月,首都經濟貿易大學經濟學院,中國北京
  • 1998年9月至2004年9月,北京首都經濟貿易大學信息學院
  • 1996年4月- 1998年9月北京首都經濟貿易大學信息學院講師

入選榮譽及獎項

  1. 2009年美國數學學會聯合數學會議旅行補助金,2008年秋季
  2. 2006年秋季獲密歇根理工大學研究生院旅行補助金
  3. 2005年8月- 2008年12月密歇根理工大學研究生研究/教學助教
  4. 首都經濟貿易大學青年教師優秀研究獎2004年5月

專業的會員

  • 2004年至今,美國統計協會會員
  • 2009年至今,美國人類遺傳學學會會員
  • 2012年至今,美國科學促進會成員
  • 2010 - 2011年,希望之城綜合癌症中心準成員

出版物

  1. 王旭,張世林,李勇,沙強。在混合人群中測試罕見變異最優加權組合的一種強大方法。《遺傳流行病學》,39(4):329 - 329,2015。PMID: 25758547
  2. 王旭,孫曉林,Quiñones-Lombraña A,辛格P,等。CELF4變異與蒽環類藥物相關心肌病的COG研究(ALTE03N1)。JCO, 2015年。(新聞)
  3. 王霞,趙霞,周傑。使用不同加權方案的基於家庭的測試來檢測高血壓的罕見變異。BMC Proc. 2015(已出版)
  4. Xia S, Kohli M, Meijun D, Dittmar R, Lee A, Nandy D, Yuan T, Guo Y, Wang Y, Tschannen M, Worthey E, Jacob H, See W, Kilari D, Wang X, Hovey R, Huang CC, Wang L.血漿遺傳和基因組異常預測晚期前列腺癌的治療反應和臨床結局。Oncotarget,在線發布,2015年4月15日
  5. 王曉東,王曉東,王曉東,王曉東等。顆粒物暴露,產前和產後易感性窗口和自閉症譜係障礙。流行病學,26(1):30-42,2015。PMID: 25286049
  6. 夏珊,黃春成,樂明,Ditmar R,杜敏,袁濤,郭豔,王豔,王霞,蔡s, Suster S, Mackinnon AC,王磊。早期肺癌與正常對照的漿細胞遊離1 DNA基因組變異。肺癌,2015年。(新聞)
  7. 朱慧,王誌,王霞,沙強。一般家係中罕見變異關聯研究的一種新統計方法。BMC Proc. 2015(已出版)
  8. 王旭,劉偉,孫春林,等。透明質酸酶合成酶3 (HAS3)變異和蒽環類藥物相關心肌病-來自兒童腫瘤組的報告。JCO。32(7): 647 - 2014。PMID: 24470002
  9. 王曉霞*,趙曉霞,等。含遺傳變異的癌症風險預測模型綜述。癌症信息學。增刊2,2014年19-28。PMID: 25288876
  10. 趙旭,沙強,張鬆,王旭*。高血壓的最佳加權變異組合測試。BMC Proc. 8(增刊1):S59, 2014。
  11. Ahrenhoerstera LS, Tate ER, Lakatos PA, Wang X, Laiosa MD.發育暴露於2,3,7,8四氯二苯並對二惡英會減弱造血幹細胞進行淋巴細胞分化的能力。中國藥理學雜誌,2014,27(2):344 - 344。
  12. 沙強,王旭,王曉麗,張世林。基於最優加權變異組合的罕見和常見變異關聯檢測。遺傳流行病學雜誌,36(6):561-571,2012。PMID: 22714994
  13. Ferguson J, Hinkle C, Mehta N, Bagheri R, DerOhannessian S, Shah R, Wolfe M, Bradfield J, Hakonarson H, Wang X, Master S, Rader D, Li M, Reilly M.脂蛋白相關磷脂酶A2在炎症和動脈粥樣硬化中的轉化研究。中國心血管病雜誌。39(8):764- 77,2012。
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  19. 王旭,張震,張世林,沙強。采用兩階段方法進行全基因組關聯檢測,並對家族和非親緣個體進行統一分析。BMC Proc. 1(增刊1):S140, 2007。PMID: 18466484
  20. 王X *。基於股權比例的風險投資各方委托代理模型研究。《數量經濟學與技術經濟學》,2005年第2期,121-126。
  21. 王X *。《不鏽鋼市場分析與預測》,《華晨》,2004年8月20-21日。
  22. 王X *。分段風險投資最優收益模型研究。首都經濟貿易大學學報,3:57-60,2004。
  23. 王X *。汽車銷售不受保險費用上漲的影響。《金融新聞》,2004年7月6日
  24. 王X *。銀行信息處理趨勢預測。《金融新聞》2004年6月26日5日。
  25. 金曉亮,王霞。北京市國民經濟發展狀況分析。經濟管理研究,4:31-35,2001。
  26. 王X *。用SWARM進行經濟模擬:基於代理的模型和麵向對象的程序設計。《數量經濟學與技術經濟學》,2001,5:63-64。
  27. 謝震,王旭。按揭證券的結構分析。當代法學,1:127-135,2001。
  28. 王X *。北京市實際估計投資的分析與測算。首都經濟貿易大學學報,4:71-74,2000。

審查和準備中的手稿

  1. 王震,王旭,沙強。稀有變異關聯研究中多性狀的聯合分析。《人類遺傳學》2015年版。(審查)
  2. 王欣,孫麗霞,辛格,Bhatia S.遺傳變異作為癌症幸存者治療暴露與腦癌之間關係的修飾因子。2015.(準備提交給臨床腫瘤學雜誌)
  3. 王欣,錢東。基於密度自適應分布擬合的快速準確p值估計,2015(準備中)
  4. 王霞,朱霞,李晨,李敏。混合群體遺傳關聯分析中基於家係的地方血統調整方法,2015(準備中)
  5. 王霞,張世林,李敏,沙強。混合群體中稀有變異數量性狀優化加權組合的檢驗,2015(準備中)

書的章節

  1. 景體華,徐靜,寧玲,王旭等(2004)SWARM中的經濟仿真:基於代理的建模和麵向對象編程(第4、8、11章)。社會科學文獻出版社,北京。
  2. 王同三,張守義,齊建國,李富強,王旭等(2001). 21世紀定量計量經濟學。中國統計出版社,北京。
  3. 胡代光、高紅業、王旭等(2000)《經濟學詞典》。經濟科學出版社,北京。

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