KhawarSohail西迪基
KhawarSohail西迪基
助理教授

生命科學部門
法赫德國王石油和礦產大學
沙特阿拉伯

教育

博士(生物化學係生物技術中心)*倫敦大學帝國理工學院(18-07-1990)。

傳記

他在帝國理工學院的酶生物技術和蛋白質化學領域獲得博士學位,師從FRS的Brian S Hartley教授,然後加入巴基斯坦費沙拉巴德的國家生物技術和基因工程研究所(NIBGE),在那裏他從事木聚糖和纖維素降解的酶學研究,並教授MPhil(生物技術)課程。2001年,他加入澳大利亞悉尼新南威爾士大學生物技術與生物分子科學學院,利用色譜、電泳、生物量熱法(iTC、DSC)、熒光、CD光譜和質譜等多種工具,從事嗜極菌、基因和化學修飾蛋白的蛋白質結構-功能-穩定性分析和酶生物技術。他目前在沙特阿拉伯達蘭的法赫德國王石油和礦產大學生命科學係工作。


研究的興趣

  1. 蛋白質structure-function-stability關係
  2. 具有生物技術重要性的酶的動力學、生化、生物物理和熱力學表征。
  3. 嗜極酶和多嗜極酶
  4. 對酶進行化學/基因修飾以提高其催化性能。
  5. 蛋白質分析的生物物理工具(生物量熱法,熒光光譜法,圓二色法,電泳,色譜法等)
  6. 蛋白質分析的生物信息學工具
  7. 酶生物技術(分離、表征和應用)
  8. 磁酶和酶回收
  9. 了解蛋白質穩定性和延長酶活性

專業的活動:

Technicalandpersonalskills:

  1. 利用熒光光譜法、圓二色(CD)和紫外可見分光光度法、量熱法、質譜法、蛋白質電泳、比色法和量熱酶法等技術對生物大分子進行結構分析
  2. 用柱層析法從真菌,細菌,植物中純化蛋白質
  3. 與其他專家小組合作用於蛋白質結構研究的技術包括質譜、小角度x射線散射(s薩克斯)和x射線晶體學
  4. 指導/協助指導研究生,管理蛋白質化學和酶技術實驗室和設備,培養學生和同事。
  5. 設計和進行實驗,分析數據,撰寫有關酶的工業應用的論文和撥款申請。
  6. 優秀的書麵和口頭溝通能力,包括研討會,講座,論文/評論寫作。
  7. 團隊合作,友好,喜歡合作研究
  8. 精通IT,熟練使用microsoft office,數據分析軟件(Origin, SigmaPlot,酶動力學)和生物信息學工具。
  9. 完成輻射安全培訓、危險物質、綠色實驗室環境合規、實驗室安全意識-員工、研究主管職業健康安全意識課程,並參加新南威爾士大學提供的職業健康安全意識在線課程。

出版物

  1. 西迪基KS2015.違背酶的活性-穩定性權衡:利用熵的優勢增強活性和熱穩定性(Crit。生物科技啟》。在出版社)。
  2. 西迪基KS2015.有些人喜歡熱的,有些人喜歡冷的:依賴溫度的生物技術應用和嗜極酶的改進。Biotechnol。在出版社(DOI: 10.1016/j.b ectechadv .2015.11.001)。
  3. 格列羅G,豪斯曼J- f,施特勞斯J,爾坦H和西迪基KS(2015)木質纖維素生物質的生物合成、降解和工業利用。生命科學。(在出版社)
  4. Ertan H, Cassel C, Verma A, Poljak A, Charlton T, Aldrich-Wright J, Omar SM,西迪基KS和Cavicchioli R(2015)一種新的廣泛特異性堿性金屬蛋白酶假單胞菌從冷藏牛奶中分離出的鈣在提高酶產率中的作用Catal j·摩爾。B:酶113:1-8
  5. 格列羅G,豪斯曼J- f,施特勞斯J,爾坦H和西迪基KS(2015)解構植物生物量:關注真菌和嗜極細胞壁水解酶。植物科學。234:180 - 193
  6. 西迪基KS, Ertan H, Charlton T, Poljak A, Dawood Khaled AK, Yang X, Marshall G和CavicchioliR(2014)多功能過氧化物酶降解腐殖質物質:使用等溫滴定量熱法評估動力學,及其在工業廢物中的應用。178:1-11生物科技j .》。
  7. Najnin T,西迪基KSCurmi PM, Cavicchioli R 2014。南極甲烷菌中溫度響應雙組分調節係統的表征,Methanococcoidesburtonii。第28屆蛋白質學會年會,聖地亞哥,加州,2014年7月27-30日。蛋白質科學, 23:109 - 110。
  8. Das T, Sehar S, Koop L, Wong YK, Ahmed S,西迪基KSManefield M(2014)鈣在細胞外DNA介導的細菌聚集和生物膜形成中的影響。《公共科學圖書館•綜合》(9:e91935。doi: 10.1371 / journal.pone.0091935)
  9. 西迪基KS和Cavicchioli R(2006)冷適應酶。生物化學年度評論.卷。75:403 - 433。
  10. Cavicchioli R,西迪基KSSowers KR和Andrews D(2002)低溫嗜極菌及其應用。生物技術的最新觀點.13: 253 - 261。
  11. Cavicchioli R, Charlton T, Ertan H, Omar SM,西迪基KSWilliams TJ(2011)嗜冷菌酶的生物技術應用。微生物生物技術4:449 - 460。
  12. 西迪基KS, Williams TJ, Wilkins D, Yau S, Allen MA, Brown MW, Lauro FM和Cavicchioli R(2013)嗜冷者。地球與行星科學年度評論。41卷:87 - 115。
  13. 二灘H,西迪基,KSMuenchhoff J, Charlton T, Cavicchioli R(2012)利用等溫滴定量熱法對雜交多功能過氧化物酶功能性質的動力學和熱力學表征:對錳過氧化物酶活化和木質素過氧化物酶抑製的洞察Biochimie94:1221 - 1231。
  14. 茱莉亞Muenchhoff J,西迪基KS, Neilan BA(2012)對原核l -精氨酸的嚴格底物特異性和活性位點穩定性至關重要的兩個殘基的鑒定:glycineamidinotransferaseCyrA。2月279:805 - 815。
  15. Pilak O, Harrop SJ,西迪基KS, Chong K, De Francisci D, Burg D, Williams TJ, Cavicchioli R, Curmi PM 2011來自南極古生菌的伴侶蛋白主要是單體:開放態單體的晶體結構。環境Microbiol13:2232 - 2249。
  16. Muenchhoff J西迪基KSPoljak一個,阿布喬丹巴羅KDNeilan BA(2010)一種新的原核l -精氨酸:甘氨酸氨基轉移酶參與圓柱精蛋白的生物合成, 2月J277(18): 3844 - 3860。
  17. De francisco D, Campanaro S, Kornfeld G,西迪基KS, Williams TJ, Ertan H, Treu L, Pilak O, Lauro FM, Harrop SJ, Curmi PM, Cavicchioli R(2010)來自南極古生菌的RNA聚合酶亞基E/FMethanococcoidesburtonii與特定種類的mRNA結合。環繞。Microbiol。13:2039 - 2055。
  18. 西迪基KS, Poljak A, De Francisci D, Guerriero G, Pilak O, Burg D, Raftery MJ, Parkin DM, Trewhella J, Cavicchioli R(2010)熔融球狀狀態的化學修飾α-澱粉酶具有熵驅動增強的熱穩定性。蛋白質工程師23日(10):769 - 780。
  19. 西迪基KS, Parkin DM, Curmi PM, De Francisci D, Poljak A, Barrow K, Noble MH, Trewhella J, Cavicchioli R(2009)一種提高蛋白酶在低溫下催化效率的新方法:通過化學修飾減少底物抑製。BiotechnolBioeng103(4): 676 - 86。
  20. Allen MA, Lauro FM, Williams TJ, Burg D,西迪基KS、De Francisci D、Chong KW、Pilak O、Chew HH、De Maere MZ、Ting L、Katrib M、Ng C、Sowers KR、Galperin MY、Anderson IJ、Ivanova N、Dalin E、Martinez M、Lapidus A、Hauser L、Land M、Thomas T、Cavicchioli R(2009)嗜冷古生菌基因組序列,Methanococcoidesburtonii:基因組進化在寒冷適應中的作用。ISME J3(9): 1012 - 35。
  21. Afzal AJ, Bokhari SA和SiddiquiKS(2007)高活性木聚糖酶的動力學和熱力學研究ScopulariopsisSp:必需氨基的存在。ApplBiochemBiotechnol.141(2 - 3): 273 - 97。
  22. 西迪基KS, Poljak A, Guilhaus M, Francisci D, Curmi PMG, Feller G, D’amico S, Gerday C, Uversky V N和Cavicchioli R(2006)賴氨酸與精氨酸在酶冷適應中的作用:將賴氨酸修飾為同精氨酸穩定冷適應的A -澱粉酶Pseudoalteramonashaloplanktis蛋白質:結構體。函數。生物信息學。64 (2): 486 - 501
  23. Giaquinto L, Curmi PMG,西迪基KS(2007)。古生菌冷休克蛋白(Csps)的結構與功能.j . Bacteriol.189: 5738 - 5748
  24. 西迪基KSFeller G, D’amico S, Gerday C, Giaquinto L和Cavicchioli R (2005a)活性位點是多結構域冷適應a-澱粉酶展開路徑中最不穩定的結構。j . Bacteriol。187 (17): 6197 - 6205
  25. 西迪基KS李國強,Poljak A, Guilhaus M, Feller G, D’amico S, Gerday C和Cavicchioli R (2005b)二硫化物橋在冷活性A -澱粉酶活性和穩定性中的作用。j . Bacteriol.187 (17): 6206 - 6212
  26. 西迪基KS和Cavicchioli R(2005)提高了冷適應脂肪酶B的熱穩定性和活性南極假絲酵母經過氧化多糖的化學修飾。極端微生物9 (6): 471 - 476
  27. 阿夫紮爾AJ,阿裏S,拉提夫F,拉約卡米和西迪基KS(2005)純化超活性木聚糖酶的動力學和熱力學分析Scopulariopsissp。達成。物化學。Biotechnol.120 (1) 51 - 70
  28. 西迪基KS, Afzal AJ, Bokhari SA和Singh S(2004)基於Kramers理論研究高粘度條件下酶動力學的新熱力學關係。IUBMB生活56 (7): 403 - 407
  29. 西迪基KSPoljak A和Cavicchioli R(2004)通過使用四羧基二苯甲酮衍生物化學修飾脂肪族或氨基基團,提高嗜冷和中溫生物堿性磷酸酶的活性和穩定性。細胞與分子生物學(5): 657 - 667。
  30. 西迪基KS, Cavicchioli, r .和Thomas, T(2002)耐冷和嗜熱古菌中延伸因子2 (EF-2)蛋白的熱力學激活性質.極端微生物6: 143 - 150
  31. Bokhari SA, Afzal AJ, Rashid MH, Rajoka MI和西迪基KS(2002)羧甲基纖維素酶表麵羧基與苯胺的化學修飾偶聯:在水和水混相有機混合物中的極熱穩定性。Biotechnol。進步.18: 276 - 281。
  32. 西迪基KS, NajmusSaqib, AA, Rashid MH和Rajoka MI.(2000)羧基修飾顯著改變了純化的羧甲基纖維素酶的動力學性質黑曲黴酶與微生物技術27, 467 - 474。
  33. 西迪基KS, Rangarajan M, Hartley BS, Kitmitto, A, Panico, M, Blench, IP和Morris HR (1993) d -木糖異構酶:熱溶素的部分蛋白水解。生物化學J。289年,201 - 208。
  34. 西迪基KS,洛維尼-安德頓T,蘭加拉詹M和哈特利BS (1993)節細菌屬D -木糖異構酶:羧基的化學修飾和最佳pH值的蛋白質工程。生物化學J。296(3), 685 - 691。
  35. Afzal AJ, Bokhari SA, Rashid MH, Rajoka MI和西迪基KS(2000)在高分辨率堿性冷原位原生(HiRACIN)-PAGE和高分辨率原位抑製原生(HiRISIN)-PAGE上檢測聚合物降解酶的兩種簡單快速的方法。Biotechnol。列托語.22(11) 957 - 960。
  36. 西迪基KS, Shemsi AM, Anwar MA, Rashid MH和Rajoka MI(1999)羧甲基纖維素酶表麵電荷通過化學修飾的部分和完全改變:在水可混溶有機溶劑中的熱穩定。酶。Microbiol。拋光工藝.24歲,599 - 608。
  37. 拉希德MH和西迪基KS(1998)羧基修飾:高溫激活電荷中和和電荷反轉β -葡萄糖苷酶黑曲黴Biotechnol。達成。物化學.27日,231 - 237。
  38. 拉希德MH和西迪基KS(1998)天然β -葡萄糖苷酶和化學修飾β -葡萄糖苷酶穩定性的熱力學和動力學研究黑曲黴生物化學過程.33(2), 109 - 115。
  39. Shemsi AM, Ahmad T, Rashid MH和西迪基KS(1997)分離蛋白質中非共價附著多糖的室室電泳裝置的自動化。酶的微生物。拋光工藝。22(1), 76 - 77。
  40. 拉希德,MH, NajmusSaqib AA, Rajoka MI和西迪基KS(1997)原生酶遷移率測定法(NEMSA):一種監測羧甲基纖維素酶羧基修飾的新方法黑曲黴Biotechnol。技術11:4, 245 - 247。
  41. 西迪基KSNajmusSaqib AA, Rashid MH和Rajoka MI(1997)羧甲基纖維素酶的熱穩定性黑曲黴通過羧基修飾。Biotechnol。列托語.第4節325 - 329。
  42. 西迪基KS,Rashid MH, Shemsi AM和Rajoka MI(1994)一種從細胞外產生的β -葡萄糖苷酶中分離多糖的簡單和非破壞性的方法曲黴屬真菌niger.Enzyme.Microbial.Technol.16(10), 912 - 917。
  43. 西迪基k ., Azhar M.J, Rashid MH和Rajoka MI(1996)羧甲基纖維素酶活性和熱穩定性黑曲黴受到非共價多糖的強烈影響。World.J.Microbiol。Biotechnol.12(3), 213 - 216。
  44. 拉希德MH和西迪基KS(1996)細胞外β -葡萄糖苷酶的穩定性黑曲黴被非共價附著多糖顯著增強。葉形線Microbiol.41(4), 341 - 346。
  45. 西迪基KSRajoka MI, Rashid, MH, Durrani, IS, Ghauri TM和Rajoka MI (1997)Cellulomonasbiazotea世界。j . Microbiol。Biotechnol。13日,245 - 247。
  46. 西迪基KS, Azhar MJ, Rashid MH和Rajoka MI(1997)羧甲基纖維素酶活性位點殘基的穩定性和鑒定黑曲黴而且Cellulomonasbiazotea葉形線Microbiol.42歲,312 - 318。
  47. 西迪基KS和Ali R(1991)一種敏感和簡化的十二烷基硫酸鈉蛋白凝膠染色方法。技術, 3(4), 187 - 190。

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