文摘

非洲豬瘟(ASF)是其中一個最重要和複雜的傳染病影響豬(Susscrofa)。疾病傳播可能代價高昂,導致出口的損失。非法無症狀的存在載波豬繁殖和接觸牲畜和野豬(WB)在缺乏生物安全的情況下是主要的風險因素,導致許多地區的持久性ASF的撒丁島,意大利,自1978年以來一直存在的疾病。重要的公共衛生項目實現了撒丁島人地區權威和具有強有力的措施來消除自由放養的豬和激勵的實踐。滿意的結果減少疫情的數量和ASF患病率已經觀察到。然而,臨界點依然存在,如必要的時間獲得診斷結果ASF檢測在世行在狩獵季節死亡。經過現場評價的一個商業血清學裝備測試,能夠降低成本和人力,評價抗原現場測試(INGENASA^©)(PS)設備測試領域也表現評估未來的前瞻性相結合使用。樣本WB獵殺在2016/2017和2017/2018賽季。四百隻動物後立即進行了PS工具的捕獵,和血液收集非洲豬瘟病毒病毒學分析篩選。敏感性(76.5%)和特異性(98%)的PS測試高於設備的主要結果。使用PS的測試可以允許快速診斷和減少不必要的屍體的破壞。利用獨立測試相結合的策略(並行)和結果的解釋的ASF區域表明了作者作為一個有用的工具進行定期監測在緊急情況下,特別是在根除疾病的最後階段。

關鍵字

非洲豬瘟;現場測試;抗原;風險;多重態;貝葉斯潛在類別分析

介紹

非洲豬瘟(ASF)是一種傳染性疾病引起的家畜和野生豬[1]非洲豬瘟病毒(ASFV) dsDNA病毒屬的在家庭中Asfivirus Asfarviridae [2]。ASF的特點是高傳染性和死亡率和涉及範圍廣泛的症狀,從輕微疾病致命的出血熱[3]。ASFV還複製Ornithodoros軟蜱蟲,然後作為病毒水庫,在風險因素起著重要的作用在非洲和伊比利亞Paenisula [4]。在歐洲,ASF首次引入在葡萄牙(1957),隨後蔓延到其他國家,如西班牙,終於消滅了。目前,該病流行在撒哈拉以南的非洲國家和撒丁島(意大利),造成嚴重的經濟和社會損失(5、6)。橫貫大陸後擴散到2007年格魯吉亞和東歐,ASF目前俄羅斯聯邦、烏克蘭、波蘭、拉脫維亞、立陶宛、愛沙尼亞、摩爾多瓦、捷克共和國、白俄羅斯、匈牙利和羅馬尼亞[7]。相比,在這一地區的疫情非洲森林型周期包括疣豬,這是認識到野豬(WB)一個重要的角色在疾病維護(3 8)。經濟後果,特別是由於出口限製,強調執行ASF根除活動和項目的重要性。盡管已經取得了很大的進步在診斷(9、10)和ASF免疫研究,沒有疫苗或治療選項可用來防止或限製感染[11]。當前缺乏增加微分ASF實驗室診斷的重要性,幫助根除計劃。 In Sardinia, the disease has been present since 1978, and the epidemiological situation is influenced by factors, such as the illegal free ranging of pigs in WB territories [12,13]. The incidence of ASF increased from 2011 to 2014, when the disease spread swiftly into territories outside the endemic area [5]. The implementation of Public Health programs is essential for controlling the disease. A new Plan of Eradication for ASF 2015-2018 ((PEASF-15-18) Regional Decree Number 50/17, 16 December 2014) was developed by the Sardinian Region Authority, in accordance with the European Commission. The plan established specific serological and virological measures in terms of screening activity, suspicion of disease, and slaughter for self-consumption. The surveillance plan for wildlife is geographically limited to those areas in which outbreaks of ASF occur in WB. This area is defined as the “infected zone” (IZ), and surveillance activities within this zone are different from those of the remaining Sardinian territory. Control and management of the hunting season is another important goal of the plan, and includes the application of strong rules involving carcass checks and workmanship of the meat. A significant decrease in disease prevalence, both in virological and serologic prevalence, has been observed inside and outside the IZ since the application of PE-ASF-15-18 (Table 1). One of the final steps in the eradication program is the facilitation of early detection of ASF, by not only veterinarians and the authorities, but also by hunters and farmers. As previously demonstrated [14,15], the use of a field test on both WB and illegal free-ranging pigs can be a valuable tool with economic and time saving benefits. Experimental detection of ASFV-specific antibodies was first performed by Perez, et al. [16] from experimentally infected pigs, and the Pen-Side (PS) test met the sensitivity (SE) and specificity (SP) parameters (SE=99%; SP=100%) set by the World Organization for Animal Health. In 2016, Sastre, et al. [17] evaluated the performance of the PS test on field samples obtained from outbreaks in EU countries and surveillance programs. The validation of antibody testing in the field was then carried out by Cappai, et al. [14] using samples from a high ASF risk zone, where illegal pigs and WB live closely together. WB were tested with the PS test and an ELISA or immunoperoxidase monolayer assay (IPMA). On ROC curve analysis, the test was defined as moderately accurate, based on Swets agreement [18] (SE=81.8%; SP=95.9%; positive predictive value (PPV)=69.3%; negative predictive value (NPV)=97.9%). These studies confirm that the PS test offers advantage and benefits, especially in field scenario, as a rapid, economic, and simple-to-use tool with a high SP. To our knowledge, no study has been performed to evaluate the performance of the PS test for antigen detection. The aim of this work was evaluate the use of the PS test for antigen detection of ASFV in the field, and to assess any potential difficulties related to test execution. In addition to performing the PS test in 400 WB, a questionnaire was completed for each test.

			受感染的區域(子)					不是感染區(NZI)
狩獵 季節	世行的獵殺	世行病毒測試	病毒pos	病毒:	世行血清檢測	pos	上一頁	世行血清檢測	pos	上一頁
2010/11	1596年	626年	0	0.00	754年	16	2.12	785年	0	0.00
2011/12	7775年	3383年	25	0.74	3817年	143年	3.75	3693年	23	0.62
2012/13	6224年	2363年	11	0.47	3256年	340年	10.44	2759年	13	0.47
2013/14	10419年	2047年	40	1.95	3431年	269年	7.84	4405年	2	0.05
2014/15	11361年	1479年	9	0.61	3676年	271年	7.37	3947年	8	0.20
2015/16	12734年	2859年	13	0.45	3549年	240年	6.76	6621年	5	0.08
2016/17	15673年	4106年	39	0.95	4898年	230年	4.70	5354年	7	0.13
2017/18	12561年	5172年	24	0.46	5177年	198年	3.82	5112年	5	0.10

表1:世行總控製在每一個狩獵年和相對血清和病毒患病率(上一頁)在感染區(子)而不是受感染區(NZI)。

材料和方法

動物采樣

本研究使用樣本完成世行在2016/2017和2017/2018狩獵狩獵季節(CVC)(圖1)。從11月1日到1月31日,張成的CVC依照PE-ASF-15-18。樣本收集的經驗豐富的獸醫最大事後時間5小時之內,Ingenasa提出的。為每個樣本數據編製的獸醫,包括關於世行性別與年齡、狩獵geocoordinate,氣候條件,PS測試存儲和測試執行的方法。此外,狩獵geo-localization被用來評估空間分布信息,確保世行的隨機選擇。使用PS (INGENASA執行測試^©)抗原檢測和實時PCR,作為黃金標準。世行信息樣本數據收集和PS和PCR檢測的結果存儲在一個特定的密碼保護微軟Office訪問數據庫和表2所示。數據一致性和準確性驗證通過廣泛的數據檢查,和任何分歧進行評估和修正。

圖1:野豬密度(動物)到島是顯示在不同red-grade顏色;在藍色的輪廓是細毛料WB感染區域,黑色區域樣本的收集。

變量	描述	縮寫	類別
x1	數量的直轄市	市	狩獵
x2	許多狩獵公司	狩獵公司	狩獵
x3	的狩獵天數	狩獵的日子	狩獵
x4	緯度	緯度	狩獵
x5	經度	長	狩獵
x6	性別(女性/男性)	性	野豬
x7	年齡的獵殺動物	年齡	野豬
x8	時間通知給狩獵公司筆,一邊測試執行(小時)	項通知時間	狩獵
x9	恰當的時間通知相關的撤軍活動組織(是/不)	項B-notice足夠	狩獵
x10	需要達到的距離撤軍活動的地方(公裏)	項C1-distance測試的地方	測試條件
x11	時間需要達到撤軍活動地點(小時)	項C2-time測試地點(小時)	測試條件
x12	現場測試測試保存(是/不)	項D-pen-side測試保存	測試條件
x13	現場測試測試執行的位置(狩獵公司技術的房間,部分避難所,開放領域,汽車)	電性能測試項目執行的地方	測試條件
x14	任何溫度變化的測試提交(是/不)	項目群野生溫度變化	測試條件
x15	在測試執行記錄溫度(°C)	項目執行實際負荷試驗溫度	測試條件
x16	氣象條件(晴朗的幹燥,濕度,下雨, 雷暴、雪)	項H-meteorological條件	測試條件
x17	用於現場測試樣品質量測試(很好,足夠了,不夠)	項目質量進行抽樣	測試結果
x18	示例撤軍和現場測試測試執行之間的時間(小時)	項J-visceral處置安全	測試結果
x19	內髒處置安全評價方法(是的/不/沒有驗證)	項目之間的常數乘以撤軍和測試	野豬
x20.	全球評估現場測試測試執行(足夠,足夠的問題,沒有足夠的)	項L-adequate測試執行	測試結果
x21	獵人的行為(合作/協作)	項M-hunter行為	狩獵
x22	任何檢查其他狩獵公司(是/不是)	項N-inspection其他狩獵公司	狩獵
x23	現場測試試驗的結果(正/負)	現場測試試驗結果	測試結果
x24	由於實時PCRtest(正/負)	實時PCRtest結果	測試結果

表2:的變量列表收集現場測試的評估測試的表現,與狩獵、野豬、現場測試測試執行條件和現場測試試驗結果。

測試程序

PS測試是檢測的檢測試紙測定ASFV的血液。血液樣本必須新鮮,試劑需要存儲4 - 25°C。在測試膜、測試和控製線路存在包含特定於ASFV單克隆抗體和控製蛋白質,分別。的控製是非常重要的指示正確測試已經完成。執行測試,20毫升的全血放入圓窗和3 - 4滴運行緩衝被添加。然後,結果被解釋在十分鍾。一個藍線表示一個消極的結果,藍線和黑線表示一個積極的結果。測試被認為是無效的,如果一個藍色的線沒有出現在十分鍾內。

統計分析

描述性分析來評估所有收集的基線分布變量和選擇相關的可能因素之間一致性/ no-concordance測試,然後進一步評估分層分析。世行年齡是表示為中位數(》四分位數)和最小最大,而分類變量表達的頻率和百分比。精度(即SE和SP)相比,新的診斷測試通常反對既定的黃金標準[19]。如果黃金標準的錯誤率是漠視和黃金標準被認為是完美的(100% SE和100% SP)在新診斷測試的評估,新測試的準確性和患病率可能低估了[20]。雖然PCR測試目前被認為是黃金標準史Zooprofilattico Sperimentale德拉薩丁島(IZS-Sardegna)實驗室具有良好的精度,其SE和SP不是100%。1995年,約瑟夫,et al。[21]提出了使用貝葉斯潛類模型(LCMs)作為一個方法來評估診斷測試的準確性,當黃金標準的準確性未知或小於100%。貝葉斯LCMs已經越來越多地用於評估診斷測試的準確性,和最近的研究表明,當黃金標準測試SEs低,貝葉斯LCMs是有用的估計的真實準確性替代診斷測試(22 - 24)。鑒於這些前提,我們決定根據兩種統計方法:分析收集到的數據分析經驗(非參數)接受者操作特征曲線(ROC)[25]和貝葉斯LCMs。曲線下的麵積(AUC)是公認的診斷測試的歧視性的權力和使用梯形積分法計算。瓦爾德測試被用來比較曲線[26]。 The graph of agreement charts (Figure 2) has been used as a valid alternative to the ROC curve graph for diagnostic tests, as explained by Bangdiwala, et al. [27]. The Bayesian LCM estimates accuracies of diagnostic tests and does not assume that any test is perfect. Rather, it considers that each test could be imperfect in diagnosing the true disease status. The true disease status of the patient population is then defined on the basis of overall prevalence. The model is then iterated using the Markov chain Monte Carlo (MCMC) method to estimate all unknown parameters, including prevalence and accuracy of each diagnostic test, and their 95% credible intervals [28]. Furthermore, Bayesian LCMs need to estimate true disease prevalence, and a 2 × 2 summary table of two diagnostic tests applied to one population does not provide enough data for this calculation [21,29]. Therefore, the Bayesian LCM analysis was performed by dividing the single WB population data set into multiple population data sets based on specific variables, such as sex and age, as suggested by Toft, et al. [30]. The Bayesian LCM was validated by checking for convergence of the Markov chains and fitness of the model used, as suggested by Lunn, et al. [31]. The final SE and SP were calculated using the OIE Real Time PCR as the gold standard, and the concordance of each test was evaluated using Kappa Coefficient (k). In order to assess the role of each variable related to concordance between diagnostic tests, a multivariable analysis of the factors listed in table 2 contributing to concordance between the PS test and PCR was conducted using a logistic multilevel mixed model (Equation (1)), with dichotomous outcome (concordance: yes/no). This model was chosen due to the fact that the logistic regression model is used to analyse the relationship between a dichotomous dependent variable and one or more independent variables. When the dependent variable is dichotomous, as in our case, the theoretical reference distribution should be the binomial distribution, rather than the normal distribution. In these cases, although it is equally possible to apply the simple regression model, a nonlinear model would be more appropriate. After careful consideration of several potentially relevant predictors, as well as both experimental and statistical requirements (such as non-collinearity), we evaluated the variables reported in table 2 as potential covariates in our modelling analyses. Multicollinearity between variables was tested, since even when ordinary least squares assumptions are not violated, the estimation is still unbiased [32]. First, correlation coefficients between variables were calculated using Spearman nonparametric correlation coefficients. The choice of variables to be included in the final model was made on the basis of Wald’s test for statistically significant results. The logistic multilevel mixed model results are presented as Adjusted Odds Ratios (OR_鄰接的)計算邏輯回歸方法[33],它考慮了所有的額外變量的影響包括在分析中。所有統計測試是雙麵的,p值< 0.05被認為是重要的。ROC曲線分析使用占據13.1軟件(StataCorp占據統計軟件:發布13日。2013年,學院站,美國TX)。貝葉斯最小公倍數推斷是基於50000次迭代後老化20000次迭代的收斂性。結果總結了後驗估計分布的中位數和信譽的間隔。貝葉斯統計加工使用R版本3.4.3,2.1.16 R WinBUGS應用程序版本,WinBUGS 3版本(英國劍橋)(34、35)。

圖2:最終結果的診斷PS圖測試提出了協議。

結果

如表3所示,58狩獵公司涉及來自27個不同的城市,和所有樣本收集在38狩獵的日子。400 b, 182女性和218名男性,與PS和實時PCR檢測每個WB決心通過牙齒的年齡分析動物,和大多數超過30個月。0.85小時的平均通知時間(標準偏差(SD) = 0.22小時)給狩獵公司PS測試執行之前被評估為足夠的81.8%(324)的獸醫。活動所需的距離和時間到達集合地點在中位數約5公裏(》四分位數= 4 - 12公裏)和平均17分鍾(SD = 0.35分鍾),分別。所有的PS測試(400年100%)妥善保存,不經曆溫度的突然變化,大多數人在狩獵中執行公司技術的房間(285年71.2%)。PS測試執行期間記錄的平均溫度是17.7°C (SD = 4.5°C),和陽光和幹燥是最頻繁的氣象條件(288年72%)。之間的平均時間2小時了樣本收集和測試執行PS。質量被定義為好的樣本(173)的73.3%,然而幾集的內髒處理檢查(不驗證= 314,78.5%)。測試執行主要是定義為充足(281年70.3%)。總共有325(81.2%)狩獵公司合作,在75年(18.8%),和324年(81%)其他狩獵公司檢查是可能的。 As reported in table 4, 44 Real Time PCR tests were positive and 356 Real Time PCR tests negative for ASFV, while 35 PS tests were positive and 365 PS tests negative. Based on ROC analysis (AUC=0.82, standard error (SE)=0.036, 95% CI [0.749-0.892], p <0.05), the PS test was moderately accurate (SE=65.9%, 95% CI [50.0- 79.1]; SP=98.3%, 95% CI [96.2-99.3]; positive predictive value=82.8%, 95% CI [65.7-92.8]; and negative predictive value =95.9%, 95% CI [93.2-97.6] Sweets, 1988). The Bayesian LCM was applied for the two populations of young (0-6 and 6-18 months old) and old (18-30 and >30 months old) WB tested. Tables 5a and 5b describe the PS and Real Time PCR test results in the contingency table used to perform the Bayesian analysis. Setting Real Time PCR as the perfect gold standard and using non-informative prior Beta (0.5, 0.5) distribution for Real Time PCR test’s SE and SP, the PS test detected 85.9% of true positives (PPV=85.9%, 95% CI [70.3-96.4]) and 97.4% of true negatives (NPV=97%, 95% CI [95.0-99.3]), with SE =76.5 (95% CI=59.0-92.1) and SP=98.6 (95% CI=96.9-99.7). As described by Berger, et al. [36], Bayesian LCM result estimates are reliable only when the chains in the Bayesian LCM converge properly. If the two chains do not converge, the parameters estimated by the model are unreliable. As shown in figure 3, the SE and SP chains converge, and the frequencies predicted by the Bayesian LCM fit with the observed data. Therefore, it is possible to affirm the goodness of the model’s fit. Furthermore, the goodness of fit for the Bayesian LCM should be evaluated based on agreement between “frequency observed” and “frequency predicted” using Bayesian p-value and posterior predictive distribution of each profile. The Bayesianp值的概率是複製數據(預測頻率)從貝葉斯模型比從觀測數據更極端。貝葉斯假設機率接近0或1表明,觀測結果不太可能出現在複製的數據如果模型是真實的。這意味著當貝葉斯p值接近0.5或0.5,貝葉斯模型描述了觀測數據很好。頻率預測的值應接近觀察到的頻率值。表6顯示了假定值獲得貝葉斯最小公倍數的年輕和年老的人群。因為所有的p值相等或接近0.5,這證實了一個很好的健身的最終模型。圖3 a -提出了預測的預測後的直方圖分布頻率,和紅色的線條代表觀察到的頻率每個測試結果的概要文件。在每個數據,數據集複製20000倍2000倍,隻選擇(薄抽樣= 10)評估頻率,觀察到的概率假設模型是正確的。最後,期間收集的所有變量抽樣進行評估,盡可能解釋的變量,以發現任何參與診斷測試之間的不和諧因素。多級邏輯模型的結果報道在表7中,包括四個解釋的變量:電性能測試項目執行的地方(空曠的田野,狩獵公司技術的房間,部分住所,或汽車);項目質量進行抽樣(好、足夠的或不夠);項目之間J-time收集和測試(小時);項L-adequate測試執行(是的或問題沒有足夠的);和項目M-hunter行為(合作或不合作),不包括那些不具有統計學意義。所有可能的變量之間的相互作用進行了評估,沒有統計上顯著的交互條款被發現。 The results obtained by multivariable analyses performed to explore the variation of the effect size for the considered factors on diagnostic tests concordance highlighted that the performance of the test in a safe place, such as the hunting company technical room, improved the concordance in contrast to the execution in the open field with statistical significance (OR_鄰接的= 9.423 (95% CI = 3.645 - 24.361),p< 0.0001)。質量好的樣品之間的一致性測試的概率增加了三倍,相比低樣本(或質量_鄰接的= 2.975 (95% CI = 1.602 - -5.527),p= 0.001)。之間的時間跨度增加樣本收集和PS測試執行被認為是一個重要的危險因素,分析確認其傾向於阻礙之間的一致性測試30%時(或時間超過一個小時_鄰接的= 0.702 (95% CI = 0.583 - 0.859),p< 0.0001)。一般測試執行情況評估適當的獸醫增加實時PCR和PS之間的一致性測試,大約五倍(或= 5.217 (95% CI = 2.049 - -13.291),p= 0.001)。此外,狩獵的合作公司,增加了和諧的獸醫操作(或10倍_鄰接的= 10.425 (95% CI = 4.041 - -26.898),p< 0.0001),有統計學意義的結果。

圖3:貝葉斯最小公倍數的輸出模型的敏感性和特異性抗原檢測PS測試。

變量	(min-max)意味著(SD);n (%); 中位數(》四分位數)
市	n = 27
狩獵公司	n = 58
狩獵的日子	n = 30
緯度	8、881531 - 9、72585
經度	40,193249 - 648545
性 男性 女	218例(54.5%) 182例(45.5%)
年齡 0 - 6個月 6 - 18個月 18 - 30個月 > 30個月	33 (8.2%) 68例(17%) 83例(20.8%) 216例(54%)
項通知時間(小時)	0.85 (0.22)
項B-notice足夠 是的 不 部分	324例(81.8%) 0 (0%) 73例(18.2%)
項C1-distance測試地點(公裏)	5 (4 - 12)
項C2-time測試地點(分鍾)	17 (0.35)
項D-pen-side測試保存 是的 不	400例(100%) 0 (0%)
電性能測試項目執行的地方 狩獵公司技術部分遮蔽的房間 空曠的田野 汽車	285例(71.2%) 73例(18.3%) 20 (5%) 22 (5.5%)
項目群野生溫度變化 是的 不	0 (0%) 400例(100%)
項目實際負荷試驗執行溫度(°C)	17.7 (4.5)
項H-meteorological條件 陽光明媚的幹 濕度 下雨 雷雨 雪	288例(72%) 92例(23%) 20 (5%) 0 (0%) 0 (0%)
項目質量進行抽樣 好 足夠的 不夠的	173例(43.3%) 154例(38.4%) 73例(18.3%)
項J-ti撤軍和測試(小時)	2 (0.1 - 3)
項K-visceral處置安全 是的 不 不驗證	78例(19.5%) 0 (0%) 314例(78.5%)
項L-adequate測試執行 是的 有問題但足夠 不	281例(70.3%) 119例(29.7%) 0 (0%)
項M-hunter行為 協作 不合作的	325例(81.2%) 75例(18.8%)
項N-inspection其他狩獵公司 是的 不	324例(81%) 76例(19%)

表3:基線的描述所有變量參與現場測試測試的性能評估,與狩獵、野豬、現場測試測試執行條件和現場測試的測試結果,表示為值(值)和質量(》四分位數),頻率(n)和百分比(%),最小最大。

診斷測試 結果	實時聚合酶鏈反應 積極的	實時聚合酶鏈反應 負	總
現場測試的積極	29 (82.8%)	6 (17.2%)	35
現場測試負	15 (4.1%)	350例(95.9%)	365年
總	44	356年	400年

表4:列聯表基於現場測試(PS)測試和實時PCR測試相比非洲豬瘟獲得的假陽性和假陰性的發生,用來適應接收機算子特征曲線。

診斷測試結果	實時聚合酶鏈反應積極的	實時聚合酶鏈反應負	總
現場測試的積極	16 (%)	1 (%)	17
現場測試負	8 (%)	91 (%)	99年
總	24	92年	116年

表5:年輕的列聯表(0 - 6和6 - 18個月)世行人口根據現場測試(PS)測試和實時PCR測試相比非洲豬瘟獲得的假陽性和假陰性的發生,適合使用貝葉斯潛在的類模型。

診斷測試結果	實時聚合酶鏈反應積極的	實時聚合酶鏈反應負	總
現場測試的積極	13 (%)	5 (%)	18
現場測試負	7 (%)	259 (%)	266年
總	20.	264年	284年

表5 b:舊的列聯表(18 - 30和> 30個月)世行人口根據現場測試(PS)測試和實時PCR測試相比非洲豬瘟獲得的假陽性和假陰性的發生,適合使用貝葉斯潛在的類模型。

診斷測試結果	現場測試	實時聚合酶鏈反應	觀察到的	預測	貝葉斯假設機率
年輕的白平衡人口	積極的	積極的	16	16	0.547
	積極的	負	1	1	0.499
	負	積極的	8	7	0.396
	負	負	91年	91年	0.515
年輕的白平衡人口	積極的	積極的	13	12	0.463
	積極的	負	5	4	0.437
	負	積極的	7	8	0.537
	負	負	259年	258年	0.493

表6:協議“頻率觀察”和“頻率預測”使用貝葉斯LCM假定值和後預測每個概要文件的分布。

變量	或鄰接的(95%置信區間)	假定值
電性能測試項目執行的地方 空曠的田野 狩獵公司技術的房間 部分避難所 汽車	裁判 9.423 (3.645 - -24.361) 1.812 (1.113 - -2.947) 4.214 (2.353 - -7.541)	< 0.0001 0.018 < 0.0001
項目質量進行抽樣 Goodt 足夠的 不夠的	2.975 (1.602 - -5.527) 1.038 (1.010 - -1.068) 裁判	0.001 0.008
項J-time撤軍和測試(小時)	0.702 (0.583 - -0.859)	< 0.0001
項L-adequate測試執行 是的 有問題但足夠 不	5.217 (2.049 - -13.291) 裁判 (沒有)	0.001
項M-hunter行為 協作 不合作的	10.425 (4.041 - -26.898) 裁判	< 0.0001

T能7:物流多級回歸模型的結果使用協議現場測試測試和實時PCRtest作為結果,包括統計學意義解釋的變量。結果報告為調整後的優勢比(ORadj), 95%置信區間(95% CI),假定值。

討論和結論

本研究的目的是驗證ASFV的PS抗原檢測試驗。效率的SE和SP的PS測試相比實時PCR測試定義了測試比較準確。用於驗證的大量樣本中還提供了一個概述ASF在撒丁島的實際情況,加強獲得的結果。特有的ASF的區域,如撒丁島人的領土,疾病的早期檢測是一項基本根除計劃要求。正如前麵Cappai, et al。[14],花費的時間獲得世行樣本的實驗室結果是一個風險因素參與的增加ASF暴發和疾病傳播。使用診斷設備的快速反應是至關重要的領域的監測和根除項目世行和放養豬之間的聯係。的SP的測試結果顯示其重要作用在診斷世行ASFV負麵的。提供的語句根除計劃建立在工業區,所有獵殺世行必須提交進行血清學和病毒學檢測。直到測試結果完成後,所有世行屍體必須是安全的。使用快速檢測領域進行直接可以減少這種等待期。 In fact, animals diagnosed as negative on a test with a high SP could be immediately released for consumption, allowing for a gain in time and money. In cases of positive results, measures and restrictions can be adopted immediately. However, the situation in field application could be improved considerably through the use of multiple tests (PS antigen and PS antibody) applied under a parallel test interpretation, since independent tests assess different indicators of disease [37]. The aim of using both tests in this study was to enhance the operational effectiveness of the control activities and to identify areas where further investigation is needed. The variables considered for each WB tested, those linked to test operation, and those connected to company cooperation are strictly correlated with good test results. These results support the use of this test only by trained and prepared operators. This aspect should be considered in order to achieve the test objective and to ensure the feasibility of the project in terms of cost, since most of the testing is carried out during the hunting season. A complete change in the management of disease testing during the hunting season in the future would be desirable, with operators distributed around the territory to guarantee the control and testing of the carcasses on the day of hunting, even on holidays, using the PS test.

的利益衝突

作者宣稱沒有利益衝突。

確認

本研究是一個研究項目的一部分(工業區SA RC 07/16)的史Zooprofilattico Sperimentale德拉薩丁島由衛生部。作者感謝ASSL獸醫與狩獵公司為他們的合作和關係在野豬抽樣。

引用

1. 安德森EC, Hutchings GH, Mukarati N,威爾金森PJ (1998) bushpig非洲豬瘟病毒感染(Potamochoerus porcu)及其在疾病的流行病學意義。獸醫Microbiol 62: 1 - 15。(Ref。]
2. 迪克森路,Escribano JM,馬丁斯C,搖滾DL,薩拉斯ML, et al . (2005) Asfarviridae。法奎特:厘米,梅奧馬,安大略省J, Desselberger U,球拉(eds),病毒分類。八世報告ICTV,愛思唯爾/學術出版社,英國,135 - 143。(Ref。]
3. Blome年代,加布裏埃爾C,啤酒M(2013)發病機理的非洲豬瘟豬在國內和歐洲的野豬。病毒Res 173: 122 - 130。(Ref。]
4. 桑切斯防禦率JM,牆L,馬丁內斯洛佩茲B(2013)非洲豬瘟(ASF):五年在歐洲。獸醫Microbiol 165: 45 - 50。(Ref。]
5. 牆L, Atzeni M, Martinez-Lopez B, F Feliziani, Rolesu年代,et al . (2016) Thirty-Five-Year非洲豬瘟在撒丁島的存在:曆史、進化和疾病的風險因素維護。Transbound緊急情況說63:165 - 177。(Ref。]
6. 潘瑞思毫升,Vosloo W(2009)非洲豬瘟的審查:傳輸、傳播和控製。J S誤判率獸醫協會80:58 - 62。(Ref。]
7. Sanchez-Cordon PJ,蒙托亞M,裏斯,迪克森路(2018)非洲豬瘟:重新病毒性疾病威脅著全球養豬業。獸醫J 233: 41-48。(Ref。]
8. Jori F,瓶L,潘瑞思毫升,Perez-Sanchez R,埃特爾E, et al。(2013)對非洲豬瘟的森林型周期在撒哈拉以南非洲和印度洋。病毒Res 173: 212 - 227。(Ref。]
9. Woźniakowski G, Frączyk M, Kowalczyk Pomorska-Mol M, Niemczuk K, et al。(2017)聚合酶交聯反應(PCLSR)螺旋非洲豬瘟病毒的檢測(ASFV)豬和野豬。Sci代表7:42903。(Ref。]
10. Frączyk M, Woźniakowski G, Kowalczyk Niemczuk K, Pejsak Z(2016)發展cross-priming放大的直接檢測非洲豬瘟病毒、豬和野豬血液和血清樣本。列托人:Microbiol 62: 386 - 391。(Ref。]
11. Zakaryan H,裏維拉Y(2016)非洲豬瘟病毒:當前狀態和未來的視角在疫苗和抗病毒藥物的研究。獸醫Microbiol 185: 15 - 19。(Ref。]
12. Jurado C, Fernandez-Carrion E,牆L, Rolesu年代,Laddomada, et al .(2017)為什麼非洲豬瘟仍然存在在撒丁島嗎?Transbound緊急情況說65:557 - 566。(Ref。]
13. Cappai年代,Rolesu年代,Coccollone Laddomada,減量F, et al .(2018)評價的生物和社會經濟因素與非洲豬瘟在撒丁島的持久性。Prev獸醫地中海152:1 - 11。(Ref。]
14. Cappai年代,Coccollone Rolesu年代,Oggiano, Madrau P, et al。(2016) Costi e掉內爾'utilizzo del筆一邊測試/ la ricerca anticorpale nei confronti德拉有害生物Suina非洲";總結animali da reddito 9: 57 - 62。(Ref。]
15. Cappai年代,F法則裏,Coccollone Cocco M,爾孔尼。C, et al。(2017)評估商業現場試驗檢測非洲豬瘟。53 J Wildl說:602 - 606。(Ref。]
16. 佩雷斯T, Gallardo C,分擔R, De Mia G,船帆座C, et al。(2011)開發和初步驗證現場測試的測試基於使用vp72蛋白質ASFV抗體檢測。:《6^th新發、再發豬疾病國際研討會,6月12 - 15,西班牙巴塞羅那。
17. 即將P, Gallardo C, Monedero Ruiz T,阿裏亞斯M, et al .(2016)發展新型橫向流分析非洲豬瘟檢測的血液。BMC獸醫Res 12: 206。(Ref。]
18. 不要JA(1988)測量診斷係統的準確性。科學240:1285 - 1293。(Ref。]
19. Šimundić點(2009)診斷準確性的措施:基本定義。EJIFCC 19: 203 - 211。(Ref。]
20. 巴克AA,加裏JJ(1966)比較篩選試驗和參考測試在流行病學研究。協議即指數及其與患病率的關係。我增加83:586 - 592。(Ref。]
21. 約瑟夫·L Gyorkos TW, Coupal L(1995)貝葉斯估計疾病的患病率和診斷測試的參數在缺乏黃金標準。我增加141:263 - 272。(Ref。]
22. 辛普森Limmathurotsakul D, Jamsen K, Arayawichanont,是的,白色的LJ, et al。(2010)定義的真正文化敏感性的診斷類鼻疽使用貝葉斯潛在的類模型。《公共科學圖書館•綜合》5:e12485。(Ref。]
23. Limmathurotsakul D,特納EL Wuthiekanun V, Thaipadungpanit J, Suputtamongkol Y, et al。(2012)傻瓜的金子:為什麼不完美的參考測試是破壞小說的評價診斷:重新評估5鉤端螺旋體病的診斷測試。感染說55:322 - 331。(Ref。]
24. Pan-ngum W, Blacksell SD,盧貝爾Y, Pukrittayakamee年代,貝利女士,et al。(2013)估計的真實準確性為登革熱感染使用貝葉斯診斷測試潛在的類模型。《公共科學圖書館•綜合》8:e50765。(Ref。]
25. Grzybowski M,年輕的J(1997)統計方法:III。接受者操作特征(ROC)曲線。阿德萊德大學地中海緊急情況4:818 - 826。(Ref。]
26. 風扇J, Upadhye年代,最差的一個(2006)了解接受者操作特征(ROC)曲線。CJEM 8: 19日至20日。(Ref。]
27. Bangdiwala SI, Haedo,納塔爾ML, Villaveces(2008)協議圖代替診斷測試的接受者操作特征曲線。中國論文61:866 - 874。(Ref。]
28. 斯皮格爾霍爾特Lunn D, D,托馬斯,最佳N(2009)缺陷項目:進化、批判和未來的方向。Stat地中海28:3049 - 3067。(Ref。]
29. 約瑟夫Dendukuri N, L(2001)貝葉斯建模方法之間的條件依賴性多個診斷測試。生物識別技術57:158 - 167。(Ref。]
30. 小丘N, Jørgensen E, Højsgaard年代(2005)診斷診斷測試:評估潛在的假設評估缺乏敏感性和特異性的金本位製。Prev獸醫地中海68:19-33。(Ref。]
31. 盧恩DJ,托馬斯,最佳N, Spigelhalter D (2000) WinBUGS -貝葉斯建模框架:概念,結構,和可擴展性。集權的第一版10:325 - 337。(Ref。]
32. 江於H, S,土地KC(2015)分層線性模型的多重共線性。社科Res 53: 118 - 136。(Ref。]
33. Lemeshow SA Hosmer DW(2005)邏輯回歸。:阿米蒂奇P,科爾頓T (eds)百科全書的生物統計學:CRA-G 2^nd英國版,J威利2870 - 2880。(Ref。]
34. 斯皮格爾霍爾特Gilks WR,理查森年代,D(1996)在實踐中馬爾可夫鏈蒙特卡洛。CRC出版社,1 - 512。(Ref。]
35. R發展核心團隊(2008)的語言和環境統計計算;奧地利的維也納。(Ref。]
36. 伯傑喬(1985)統計決策理論和貝葉斯分析。施普林格科學與商業媒體,1 - 617。(Ref。]
37. Thrusfield M,奧爾特加C•德•布拉斯特區我Noordhuizen JP, Frankena K(2001)贏得反射幻燈機2.0:改進為獸醫流行病學軟件。獸醫創紀錄的148:118 - 136。(Ref。]

在這裏下載PDF臨時

條信息

文章類型:研究文章

引用:Cappai年代,桑娜G F,法則Coccollone, Marrocu E, et al。(2018)非洲豬瘟在現場與抗原快速檢測設備測試。J動畫Sci Res 2 (3): dx.doi.org/10.16966/2576 - 6457.118

版權:©2018 Cappai年代,等。這是一個開放的文章下分布式知識共享歸屬許可條款,允許無限製的使用、分配、和繁殖在任何媒介,被認為提供了原作者和來源。

出版的曆史:

收到日期:7月17日,2018年

接受日期:2018年7月30日

發表日期:08年8月,2018年